Три настоятеля храма были похищены чеченскими боевиками: священник Анатолий Чистоусов был убит, иеромонах Евфимий освобождён, а судьба иеромонаха Захарии до сих пор неизвестна . С 2004 года началось восстановление храма силами подразделений Минобороны РФ, затем были выделены средства по федеральной программе при финансовом и организационном участии президента Алу Алханова и премьер-министра Рамзана Кадырова . Летом 2005 года были отлиты и переданы новые колокола, а к весне 2006 года на храм водрузили купола и кресты.